Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms