Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms