Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED23Q9ULK4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms