Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms