Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP4Q9UKK3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP4Q9UKK3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP4Q9UKK3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms