Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF221Q9UK13 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF221Q9UK13 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms