Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP25Q9UHP3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms