Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms