Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRRDQ9UH36 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRDQ9UH36 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms