Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGXB4Q9UGU5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms