Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COPS7AQ9UBW8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COPS7AQ9UBW8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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