Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms