Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms