Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LARSQ9P2J5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms