Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms