Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms