Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms