Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMOD3Q9NYL9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms