Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DLL3Q9NYJ7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DLL3Q9NYJ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms