Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms