Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D2Q9NY47 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms