Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM9Q9NXL9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms