Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms