Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM248Q9NWD8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM248Q9NWD8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms