Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms