Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms