Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB4Q9NTQ9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms