Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms