Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms