Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms