Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB3Q9NQW8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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