Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms