Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms