Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCRT2Q9NQ03 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms