Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP2Q9NPB3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP2Q9NPB3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP2Q9NPB3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms