Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCB9Q9NP78 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCB9Q9NP78 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms