Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB6Q9NP58 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB6Q9NP58 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms