Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-5Q9HDB9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms