Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms