Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf33Q9H7E9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms