Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms