Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms