Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF3Q9H094 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms