Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIF3L1Q9GZT8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms