Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ROPN1BQ9BZX4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms