Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BARHL1Q9BZE3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BARHL1Q9BZE3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms