Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUF2Q9BZD4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUF2Q9BZD4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms