Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms