Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX4Q9BYU1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms