Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCGF6Q9BYE7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms